Субсидии на возмещение затрат выделяются в рамках постановления Правительства Российской Федерации от 30 октября 2014 г. №1119 «Об отборе субъектов Российской Федерации, имеющих право на получение государственной поддержки в форме субсидий на возмещение затрат на создание, модернизацию и (или) реконструкцию объектов инфраструктуры индустриальных парков, промышленных технопарков и технопарков в сфере высоких технологий». Источником средств являются уплаченные резидентами ИП «ОЭЗ ППТ «Алабуга» в федеральный бюджет налоги и таможенные платежи (100% налога на прибыль, 50% НДС, 100% акцизов на автомобили легковые и мотоциклы, 50 % таможенных пошлин).

В 2018 году на возмещение затрат особой экономической зоны «Алабуга» Татарстан получил 1 миллиард рублей.