Алексей Комиссаров работает в Российской академии народного хозяйства и государственной службы (РАНХиГС) при Президенте Российской Федерации с 2017 года. Помимо должности проректора он занимает пост директора института Высшей школы государственного управления РАНХиГС. С 2018 года также является директором АНО «Россия – страна возможностей».

Владимир Мау, занимавший пост ректора РАНХиГС, освобожден от этой должности по собственному желанию в связи с состоянием здоровья.