Экспозиция в анфиладе — «Русское деревянное. Взгляд из XXI века» — позволяет проследить, как менялась деревянная архитектура в России на протяжении истории, как развивалось изучение деревянного зодчества. Архитектурная графика, чертежи, макеты, фотографии, предметы декоративно-прикладного искусства и архивные материалы рассказывают о первых экспедициях и исследователях древнерусского зодчества, о музеях под открытым небом, о храмовой и народной архитектуре, о русских павильонах для международных выставок конца XIX — начала ХХ века, о постройках в неорусском стиле конца XIX века и авангардных клубах 1920–30-х годов.

Выставка во флигеле «Руина» «Возрождение. Деревянные храмы Русского Севера» расскажет о деревянных храмах и часовнях Архангельской, Вологодской, Ленинградской областей и Карелии. Здесь представлены фотографии, макеты деревянных храмов, а также видеофильмы, снятые за несколько лет экспедиций.